A System of Logic, Ratiocinative and Inductive

این بزرگ‌ترین اثر فلسفی میل است. تز اصلی‌اش این است که حتی ریاضیات و منطق هم در نهایت از تجربه می‌آیند، نه از شهود پیشینی — موضعی که در زمان خودش رادیکال بود.

مهم‌ترین میراث عملی کتاب، «روش‌های میل» است: پنج قاعده برای تشخیص رابطهٔ علّی از همبستگی، که هنوز در روش‌شناسی علوم تدریس می‌شوند. کتاب دشوار است ولی برای کسی که به روش علمی جدی فکر می‌کند، متنی بنیادی است.

کتاب در شش دفتر سامان یافته: نام‌ها و گزاره‌ها، قیاس، استقرا، عملیات کمکی استقرا، مغالطه‌ها، و منطق علوم اخلاقی — یعنی علوم انسانی و اجتماعی. دفتر آخر، که می‌پرسد آیا رفتار انسان و جامعه را هم می‌توان با روش علمی بررسید، بر جامعه‌شناسی و اقتصاد قرن نوزدهم اثر گذاشت. کتاب در ۱۸۴۳ منتشر شد و میل در زمان حیاتش بارها آن را بازبینی و تجدید چاپ کرد.